A Justiça Eleitoral (JE) registrou significativa redução, do 1° para o 2° turno das Eleições 2014, na quantidade de urnas eletrônicas substituídas durante o pleito. Das 361.435 urnas sem identificação biométrica, incluindo as utilizadas para justificativas, foram substituídas, no 1° turno, 3.693 urnas eletrônicas. Já no 2° turno esse número caiu para 2.499, apresentando uma redução de 32,33%. Quanto às 72.622 urnas eletrônicas com identificação biométrica, também incluídas as de justificativas, a JE substituiu 1.582 urnas no 1° turno, e 981 no 2° turno, registrando queda de 37,99% nas substituições.
Dentre os municípios com 100 ou mais seções eleitorais, o que teve maior número de urnas substituídas foi Palmares (PE), com a troca de oito das 121 urnas eletrônicas, todas com identificação biométrica. Em segundo ficou o município de Almirante Tamandaré (PR), que teve 12 das 183 urnas eletrônicas substituídas, seguido de Moreno (PE), com a substituição de oito das 123 urnas, essas também com identificação biométrica. Outros dois municípios do Rio Grande do Sul, Camaquã e Canguçu, tiveram 10 das 155 e 158 urnas, respectivamente, trocadas. Apenas três seções eleitorais em todo o país realizaram votação manual, sendo uma em São Paulo (SP), outra em Unaí (MG), e em João Alfredo (PE).