As investigações sobre desvio de recursos na prefeitura de Santa Cruz seguem também pela Controladoria Geral da União (CGU), durante a gestão do ex-prefeito e atual deputado estadual, Tomba Farias (PSB). Depois de averiguações na construção do Posto de saúde do Maracujá, a CGU investigará obra do posto de saúde do bairro do DNER.
Através da portaria PR/RN/GAB n. 026, de 23 de junho de 2010, a procuradora Clarisier Cavalcante instaurou o inquérito. O relatório da CGU também levantou suspeitas sobre a construção da unidade de saúde, inclusive, enviará técnicos ao local para vistoriar a obra. Enquanto isso, as investigações do Ministério Público recaem sobre o convênio n° 3537, firmado entre o Ministério da Saúde e o Município de Santa Cruz/RN.